尹氏宗祠由尹氏宗族集资兴建，占地756平方米（内另存道光三年石碑三座)，砖木结构，徽派古建筑，是合淮地区保存较为完整的古建筑。宗祠户对为四颗，刻“忠厚家风”篆体四字，下立门当，使用的是莲花并蒂狮子台。主体建筑五楹三进，坐北朝南，布局规整，分前、中、后三殿。东西走向，五开间，南向，整体布局顺地势前低后高，依次排列，错落有序。外墙采用青砖垒砌，硬山顶，曲线形封火山墙。整座家庙主次分明、气势非凡。

　　前殿四角飞檐凌空欲飞，中为阁楼，高8米，长6米，宽7米。上下两层，层高4米。上层朝北为戏台，飞檐挑角。底层面南设三道门：外为月亮门，中为黑漆大门，门上方置“尹氏宗祠”匾额，里为雕花格子门。阁楼两侧建高6米，长5米，宽6米的边厅，出厦飞檐。前院东西筑青砖花墙，各开拱形门一个。

　　中、后两殿为重梁起架，砖砌封火山，两侧有走廓6间相通。中殿高8米，长16米，宽7米，重梁起架，斗拱出厦，前后无墙，为雕花格子门窗。后殿高8.2米，长21米，宽7米。内竖红灌木柱30根，柱基是八棱鼓形青石。后为砖体墙，前为花格门窗，飞角斗篷，雕梁画栋。内立“魁星执笔点状元”木雕人像。全祠雕工细腻，施金绘彩，刻有鲤鱼跳龙门，狮子滚绣球，花鸟人物图等，栩栩如生，远近闻名。

　　尹氏宗祠建成已近200年，虽经历了千灾万劫，但次次能化险为夷。抗日战争时期，日军曾对尹氏宗祠附近的民居进行毁灭性的破坏。离尹祠十几里路、建于清乾隆23年间的庞氏宗祠就被日军的钢炮炸毁。但尹氏宗祠却完好无损。1947年，在国民党统治下，尹氏宗祠曾遭到一帮劫匪的抢劫。这帮劫匪冒充饥民，以武力扒毁宗祠，抢夺祠内的粮食和其他财产。为了保护祠堂，族人团结一致，经过多日的生死搏斗，最终赶走了这帮劫匪。新中国建立后，尹氏宗祠也曾经历数次劫难，但仅伤其皮肉，未伤其筋骨，又是万幸。屡经波折，却完好保存至今，不能不说是个奇迹。

　　2004年10月28日，安徽省人民政府将其公布为第五批省级重点文物保护单位（皖政[2004]82号），整座建筑古朴沉稳，构造精美，既有明清两代官式建筑风格，又有浓郁的徽式传统建筑特色，是保存较为完整的清代建筑珍品，给人以耳目一新的感觉。